Форум » История » Генетика » Ответить
Генетика
ВЛАДИМИР-III: [quote]На параллельном форуме я договорился (в теме обсуждения прогноза на 2100) с ув. ВИРом, что добуду ему академическую статью с информацией о том, что СПИД неизлечим принципиально. И вот оттуда: цитата: По договоренности с ув. ВИРом, Ваш покорный слуга, как только покинули нас московские гости (еще хорошо, что не заехали на 3-ю улицу Строителей!), совершил научно-исследовательскую экспедицию в Библиотеку Академии Наук с целью отыскания академических статей на тему генетики СПИДа (кроме шуток - сейчас накоплено столько научных знаний, причем, очень специфических, что понятие археологические раскопки должно относиться не только к археологии). цитата: И меня ждало огромное разочарование. Я просмотрел не менее шести научных (я это подчеркиваю!) журналов из раздела генетики и цитологии, но за последние 8 (!) лет (и каких лет!) там не обнаружил ни одной статьи о ВИЧ, СПИДе и тому подобных материях. Равно отсутствуют научные статьи, которые доказывали бы излечимость СПИДа, и статьи, доказывающие его неизлечимость. Академическая наука просто самоустранилась от этой темы (и это показательно!) Так что все, что имеет человечество - это полу-популярные статьи и обзоры, на которые я ранее давал ссылки. И все. Как Вы полагаете, почему? Если же Вас интересует мнение почти специалиста, то моя современная девочка и без 5 минут жена, которая студентка нашего самого престижного питерского медвуза и как раз специализируется на этой теме (а Вы думали, откуда у меня интерес?), (она зарегистрирована на альтфоруме - не здесь - под ником Иштар) заметила, что обнадеживающий тон популярных статей, сообщающих о скорейшей разработике вакцины, необходим больным, чтобы у них была надежда на выздоровление. Цинично, но ничего другого не поделаешь. цитата: Тысяча чертей!!! Как же я забыл!??? Ведь двоюродный брат моего родителя - Сергей Алексеевич Булат - старший сотрудник ПИЯФ РАН. Вот его одна интересная статья (правда, на немного другую тему): http://hepd.pnpi.spb.ru/ioc/ioc/line021112/n2.html Так. В самое ближайшее время все академические данные будут. Зуб даю цитата: Ну ладно. Пока суд да дело, хочу поделиться другим "археологическим открытием". Я уже говорил, что шел искать преимущественно журнал "Цитология и генетика". Нашел я его быстро. Выходит он в Киеве (с 1967 года, поэтому все подозрения насчет несерьезности отпадают; это не брат всяческих "народных академий" последних 15 лет, наоборот, он возник в период реабилитации генетики). Как-то недавно, ув Мах заявил мне, что евреи (к примеру) являют собой единую и непрерывную генетическую цепь от Авраама до наших дней, отдельную от всех остальных. К несчастью (действительно, к несчастью) он вместо того, чтобы назвать еврейскую гаплогруппу цитата: Гаплогруппа (в популяционной генетике человека, науке, изучающей генетическую историю человечества) — большая группа схожих гаплотипов, которые являются рядом аллелей в определённых местах Y-хромосомы. Галпогруппы делятся на Y-хромосомные (Y-ДНК) и митохондриальные (мтДНК). Y-ДНК является прямой отцовской линией, а мтДНК прямой материнской линией, то есть дочь, мать, бабушка, прабабушка и так далее. цитата: которая характерна именно для всех евреев и более нигде не встречается (и мы бы потом элементарно проверили - так ли это), сослался на какую-то "скрытую" генетику (в генетике нет понятий "скрытая" и "явная" генетика - нет, и все!) И тут я набрел на две интересные статьи в журнале "Цитология и генетика" ISSN 0564-3783: Назарова А.Ф., Асланишвили В.О., Алхутов С.М. "Генетика и антропология народовм Кавказа и проблема происхождения "кавказоидов". № 5/2004 и Назаровой А.Ф. "К проблеме дифференциации северных монголоидов. европеоидов и америндов на территории Евразии (генетические данные) № 6/2002. Там великолепные таблицы таксономического расхождения в хронологическом порядке различных современных наций и народностейт (жаль не распечатал - спешил, да и не то совсем искал, а статьи о СПИДе - в следующий раз скопирую). Так вот. Те, кто думают, что евреи генетически ближе всего к арабам и прочим семитским народам, жестоко ошибаются. Наиболее близки евреям народы Кавказа - осетины, азербайджанцы, талыши, грузины, чеченцы, армяне - это что касается именно ближневосточных евреев. Немного дальше от них испанцы. А арабы и персы гораздо дальше, чем тоже довольно отдаленные русские и греки. Что же касается евреев в целом, то они генетически тюркский народ. Я сначала опешил и подумал: неужели Кестлер прав - вроде раскритиковали уже давно его теорию как несостоятельную. Но тут вспомнил: речь идет именно о дрейфе генов, а не о переселениях людей (иногда они не совпадают по масштабам). Дело было так: в Хазарском Каганате евреи не составляли этнического большинства, более того, скорее всего, даже среди иудаистов большинство были неевреи. После его распада какая-то часть тюрко-евреев и тюрков-иудаистов (видимо, очень небольшая, раз практически не попала в источники) переселились в Киевскую Русь, где встретились впоследствии с потоком еврейских переселенцев с Запада (после XIII-XIV вв), и их более сильные тюркские гены (которые сейчас лучше всего сохранились также в татарах) возобладали над "первично-еврейскими" (не буду употреблять неприличный термин, описывающий этот процесс, но вы поняли. что я имел в виду). А потом. поскольку доля еврейства Польши, Западной России, Словакии и Румынии в XIX веке была подавляющей в численности всего еврейства, эти гены рассеялись повсюду в мире, где жили евреи. Так что вполне можно употреблять термины: "слабые гены" и "сильные гены". И следовательно, никакой прямой и непрерывистой генетической последовательности нет. цитата: Еще интереснее генетическая история русских. Вот отгадайте, какой из народов мира ближе всего к русским? Могу спорить на... на что? что не догадаетесь. [/quote]
Чал Мышыкъ: так і є, власне. т.зв. Кельтський шельф, частиною якої є Доггер-банк, остаточно затонув лише 6 тис. років тому. Принаймні, пізнього палеоліту-мезоліту там має бути багато ну, і відсеквенованих давніх геномів ще мало, чим більше буде - тим краще :)
retrograde: Генетики что-то трындят, что ранние земледельцы Европы - из Эгейского региона. http://biorxiv.org/content/early/2015/11/25/032763 Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans
retrograde: Не вчитывался, насколько там про генетику. http://link.springer.com/article/10.1007/s10963-015-9090-8 The Aegean in the Early 7th Millennium BC: Maritime Networks and Colonization Картинка просто красивая. Due to the current absence of patterns of transition from Mesolithic to Neolithic subsistence strategies at the centre of the Anatolian Aegean coast, we define Çukuriçi XIII and Ulucak VI as pioneer sites, founded by newcomers around 6700 cal BC (Fig. 15). Barcin Höyük in the Marmara region also appears to be a pioneer site, as indicated by the recently published radiocarbon sequence (Weninger et al. 2014, p. 21, Fig. 14).
ВЛАДИМИР-III: retrograde пишет: Генетики что-то трындят, что ранние земледельцы Европы - из Эгейского региона. http://biorxiv.org/content/early/2015/11/25/032763 Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans Хм. С Крита, или из Малой Азии (зоны яфетидов)? Если с Крита, то, как видите, Леванта, хотя не только (опять из малоазиатской зоны яфетидов).
retrograde: Опять австралийцы-аборигены. http://генофонд.рф/?page_id=6548 Генетики исследовали варианты Y-хромосомы у 657 австралийских аборигенов. Среди них оказалось 56% носителей пришлых евразийских гаплогрупп и только 44% носителей коренных гаплогрупп. Авторы подтвердили гипотезу раннего (около 50 тыс. лет назад) заселения Австралии и длительной изоляции Австралии и Новой Гвинеи. Не найдено доказательств миграций в Австралию из Индии в голоцене. А вот европейская колонизация в конце XVIII века драматически снизила разнообразие коренных австралийских гаплогрупп. Эдак, века два прошло - и считайте, что половина австралийских аборигенных мужиков - это европейские мужики? Ну, где-то что-то такое я уже постил. Просто любопытно, как сильно может меняться картинка в малых популяциях за довольно короткие сроки. Знакомьтесь, 1 шанс из 2, что это европеец по папиной линии.
ВЛАДИМИР-III: А все-таки: почему генетика так мало "заметна"? Вроде вполне австралоидная морда...
retrograde: ВЛАДИМИР-III пишет: А все-таки: почему генетика так мало "заметна"? Вроде вполне австралоидная морда... Так игрек-хромосома - это же капля в геноме. Занёс европеец гаплогруппу, а потомки продолжили вариться в аборигенной популяции.
retrograde: Хотя есть один момент: Образцы ДНК были собраны от мужчин, которые идентифицируют себя как австралийских аборигенов Вдруг там закрались и потомки европейцев, которых совесть замучила за геноцид аборигенов, вот они и аборигенизировались. И ещё вот. На одном форуме показали фотку: А что, коллеги, слабо определить, кто из этих двоих австралийский абориген? Оказывается, тётка! Оба ее деда были полуаборигены. Но всегда ли капля аборигенной крови у таких вот аборигенов?
retrograde: Атлантическая бронза тоже степняки-ИЕ? http://www.pnas.org/content/early/2015/12/22/1518445113 The Neolithic and Bronze Age transitions were profound cultural shifts catalyzed in parts of Europe by migrations, first of early farmers from the Near East and then Bronze Age herders from the Pontic Steppe. However, a decades-long, unresolved controversy is whether population change or cultural adoption occurred at the Atlantic edge, within the British Isles. We address this issue by using the first whole genome data from prehistoric Irish individuals. A Neolithic woman (3343–3020 cal BC) from a megalithic burial (10.3× coverage) possessed a genome of predominantly Near Eastern origin. She had some hunter–gatherer ancestry but belonged to a population of large effective size, suggesting a substantial influx of early farmers to the island. Three Bronze Age individuals from Rathlin Island (2026–1534 cal BC), including one high coverage (10.5×) genome, showed substantial Steppe genetic heritage indicating that the European population upheavals of the third millennium manifested all of the way from southern Siberia to the western ocean. This turnover invites the possibility of accompanying introduction of Indo-European, perhaps early Celtic, language. Irish Bronze Age haplotypic similarity is strongest within modern Irish, Scottish, and Welsh populations, and several important genetic variants that today show maximal or very high frequencies in Ireland appear at this horizon. These include those coding for lactase persistence, blue eye color, Y chromosome R1b haplotypes, and the hemochromatosis C282Y allele; to our knowledge, the first detection of a known Mendelian disease variant in prehistory. These findings together suggest the establishment of central attributes of the Irish genome 4,000 y ago.
ВЛАДИМИР-III: Да, я тоже подумал на женщину. Расстояние между глазами! А мужик - типичный британец (на какого-то киноактера похож). retrograde пишет: Атлантическая бронза тоже степняки-ИЕ? И когда (и главное - как?) они туда добрались? Шнуровики? Кельтов, да, выводят из южнорусских степей, но ведь гораздо позже - уже в I тысячелетии до н.э. Хотя, конечно, баденские племена (по языку близкие к хеттам или палайцам) могли распространиться далее на запад, где им приходилось ассимилировать местных кардиалов (рето-этрусков и подобных лигуров), но навстречу хлынул поток колоколовидных кубков, и он задержал индоевропеизацию Западной Европы на 1000 лет - не меньше.
retrograde: Так-то эти ирландские бронзовики из культуры фуд-вессел, чего-то я ляпнул не подумавши. (около 2400—1500 гг. до н. э. или 2100—1700 гг. до н. э. по русской вики, c. 2400-1500BC (Needham 1996) по английской). Атлантическая бронза, конечно, позднее - около 1300—700 гг. до н. э. Но так-то всё бронза. Или бронза бронзе рознь?
ВЛАДИМИР-III: Хм... А это не какие-либо авангарды полей погребений, точнее курганных (и не говорили ли они на бастарнских языках?)
retrograde: Вот тут древнейшие индоиранцы? http://eurogenes.blogspot.com.au/2016/01/the-poltavka-outlier.html
thrary: http://polit.ru/article/2016/02/12/ps_neanderthal/ В геноме современных людей есть некоторое количество генов, проникших туда в результате встречи наших предков с неандертальцами. Два вида (или, по другой версии, два подвида) скрещивались, давая жизнеспособное потомство, и в результате в геном людей современного типа проникали архаичные варианты генов (аллели) из генома неандертальца. Подробнее о последних исследованиях, касающихся взаимоотношений Homo sapiens и Homo neanderthalensis, можно прочитать в специальном очерке «Первые европейцы». В журнале Science опубликована работа, авторы которой попытались установить, что дают современным людям гены, унаследованные от неандертальцев. В ходе масштабного статистического исследования они выяснили, что неандертальские гены увеличивают риск депрессии и аллергии. Но в других исследованиях найдены также и неандертальские гены, которые принесли людям немалую пользу. В среднем у жителей Европы и Азии около 1,5 % генома составляют гены неандертальцев. У обитателей Меланезии дополнительно от 2 до 3 % генов получены от денисовского человека. У африканцев, как правило, генов неандертальцев нет, так как скрещивание современного человека с неандертальцем произошло уже после того, как люди современного типа покинули Африку. Сравнивая геномы нескольких неандертальцев и один образец денисовского генома с современными, ученые установили около 12 тысяч неандертальских вариантов генов, присутствующих у современных людей. Чтобы установить точную функцию этих генов, требовались дорогостоящие исследования экспрессии генов в тканях или лабораторных животных. Способ обойти это препятствие независимо друг от друга придумали генетики Джошуа Эки (Joshua Akey) из Университета штата Вашингтон и Тони Капра (Tony Capra) из Университета Вандербильта в Нэшвилле. Они решили искать неандертальские версии генов в медицинской базе данных Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE) Network. Охватывая жителей девяти городов США, эта база данных связывает информацию об их геномах с историями болезней. В результате исследователи имеют возможность отслеживать корреляции между генами и симптомами болезней у десятков тысяч людей. Объединив усилия, Эки и Капра проанализировали более 6000 неандертальских гаплотипов среди генетических данных 28 416 взрослых американцев европейского происхождения. В результате они нашли около десятка неандертальских генов, которые статистически связаны с повышенным риском ряда расстройств. Например, один вариант гена повышает свертываемость крови. Возможно, более быстрая сворачиваемость крови во времена неандертальцев уменьшала риск гибели от раны при охоте на крупных животных или при родах. Но сейчас такой ген повышает вероятность образования тромбов и развития инсульта. Ряд генов оказался связан с неврологическими нарушениями, например, с депрессией, возникающей при нарушении циркадных ритмов. Другие неандертальские гены связаны с предраковыми состояниями кожи, так называемыми кератозами. Капра предполагает, что гены, отвечающие за химию мозга и устойчивость кожи к световому излучению, были у неандертальцев настроены на условия доисторической Европы, а сейчас, когда люди проводят много времени при искусственном освещении, действуют менее адекватно. Существуют неандертальские гены, которые регулируют транспортировку тиамина (витамина B1), который отвечает за метаболизм углеводов в организме. Как считает Капра, неандертальцам, в рационе которых было много мяса и орехов, было достаточно тиамина, а при питании современных людей его зачастую недостает. Исследование также выявило неандертальские аллели, связанные с недержанием, болью в мочевом пузыре и мочевыводящих путях, и даже ген, влекущий предрасположенность к никотиновой зависимости. Однако влияние генома неандертальцев на наше здоровье не всегда отрицательно. Два исследования, опубликованные в прошлом месяце в журнале American Journal of Human Genetics, определили три архаичных варианта генов, которые повышают врожденный иммунный ответ, помогающий защитить организм от бактерий и патогенных грибков. Все три гена, как говорит ведущий автор одной из работ Дженет Келсо (Janet Kelso), специалист по биоинформатике из Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка, широко распространились у европейцев и азиатов, поощряясь естественным отбором. По словам ведущего автора другой работы, Льюиса Китана-Мурчи (Lluis Quintana-Murci) из Института Пастера в Париже и Национального центра научных исследований, эти гены работают сообща, регулируя экспрессию так называемых толл-подобных рецепторов (toll-like receptors). Эти рецепторы располагаются на поверхности различных типов клеток. Они распознают различные структуры микроорганизмов и активируют иммунный ответ. Такой пример показывает, что, когда современные люди попали в новые условия, где встретились с новыми патогенами, они срезали эволюционный путь, позаимствовав полезные гены у близких родственников – неандертальцев. У неандертальцев было по меньшей мере 200 тысяч лет на адаптацию к условиям жизни на Ближнем Востоке и в Европе, прежде чем там появились современные люди. Однако гены, полезные в эпоху плейстоцена и в современных странах третьего мира, где люди живут в тяжелых условиях, могут оказаться вредными для жителей США или Европы, которые реже сталкиваются с паразитами и другими патогенами. Дженет Келсо и ее коллеги обнаружили, что архаичные иммуностимулирующие варианты генов связаны с высоким риском аллергии. «Цена, которую мы платим сегодня за усиленный иммунный ответ, это возможный вред для нас, связанный с аутоиммунными заболеваниями, воспалением и аллергиями», – говорит Льюис Китана-Мурчи. Как функционировали эти гены в организме неандертальца, не вполне ясно. Ученые предупреждают, что на основании полученных данных нельзя делать вывод, будто неандертальцы страдали депрессией или же у них был распространен рак кожи. В будущем исследователи планируют расширить поиск неандертальских аллелей и сопоставлять их с еще более обширными библиотеками современных геномов, охватывающими десятки или даже сотни тысяч человек. Они уверены, что смогут найти еще много генетического наследия неандертальцев
Андрэ Натальер: Полные геномы пигмеев указали на африканскую метисацию современного человека с архаичными гоминидами Причём случилось это 30 клн. Метисация с неизвестным подвидом архаичных хомо. Это номер! Попробуем предположить, кто бы мог подойти на роль этих неизвестных. Пигмеи, как коренное население Центральной Африки со времён культуры Читоле, могли скрещиваться с вероятными археологическими соседями по своей культуре. Т.е с теми неизвестными по геному популяциями, которые обитали в ЦАфрике к моменту прихода туда пигмеев. Итак отметаем те популяции, геном которых известен: - не неандертальцы Европы, Передней и Центральной Азии - не денисовцы Евразии - не эрингсдорфцы или штенгеймцы, претендующие на роль кого-то из неизвестных в квадранте, угадывающемся в родстве денисовцев и неандертальцев. - не идалту (?). Кто остаётся? Мы высказали предположение, что это, возможно, были группы близкие пигмеям по культуре. Т.е. носители культур СКВ Африки, Санго и Форсмит, Лупембе и Петерсбург. Это родезийцы или хельми. Родезийцы по архаичности сопоставимы с гейдельбергцами и восходят по времени происхождения к 800 клн. А вот хельми более молодые, датируются примерно 400 клн (если память не изменяет), они застали появление и идалту и саписапиенсов. Они использовали и технологии Санго и более продвинутые технологии с леваллуа СКВ Африки. Возможно, что они и были аборигенами ЦАфрики. Другой аспект интересен. В крови нас, Евразиатов, течёт кровь неандертальцев и капелька от денисовцев. А африканцы считались "чистыми сапиенсами". Увы-ы-ы, они такие же метисы... ТОлько со своими месоантропами или даже палеоантропами. Вновь подтверждается версия Темплтона и идея единого человечества. Вновь подтверждается расовый полицентризм. Хотя данные не опровергают-таки связь с какими-то родами идалту, не ставшими праотцами внеафриканского человечества и оставшимися на континенте после "исхода" "наших", но вдруг и если окажется, что эт были более древние ветви параллельных человечеств, будет интереснее
retrograde: http://генофонд.рф/?page_id=8752 Миграции из Индии в Австралию не подтверждены Y-хромосомой
retrograde: http://polit.ru/news/2016/06/21/ps_farming/ В древности на Ближнем Востоке земледелие изобрели дважды Они обнаружили резкие различия между геномами неолитических обитателей южного Леванта, включающего Израиль и Иорданию, и тех, кто жил в Загросе, в западной части Ирана. Первые земледельцы Загроса были более тесно связаны с охотниками и собирателями, которые жили в этом регионе до неолита. Такие различия в ДНК заставляют ученых подозревать, что охотники-собиратели в южном Леванте и в Иране независимо друг от друга перешли к земледелию. Шо думаете?
ВЛАДИМИР-III: Собственно, достаточно взглянуть на карту т.н. Благодатного полумесяца. Он простирается от гор Ливана (отчасти центральной Палестины) до Персидского Залива со стороны Загроса. Это преимущественно горные районы, где рос дикий ячмень, и где его по прежним расчетам в VII, а по нынешним в VIII-IX тысячелетиях до н.э. начали выращивать. Здесь с т.з. археологии, вроде бы, все понятно. Оставался неясным вопрос об этнической однородности/неоднородности пространства, но поскольку в историческое время мы находим в том же регионе значительную пестроту, можно предположить то же самое и насчет раннего неолита.
retrograde: Human Y Chromosome Haplogroup N: A Non-trivial Time-Resolved Phylogeography that Cuts across Language Families The paternal haplogroup (hg) N is distributed from southeast Asia to eastern Europe. The demographic processes that have shaped the vast extent of this major Y chromosome lineage across numerous linguistically and autosomally divergent populations have previously been unresolved. On the basis of 94 high-coverage re-sequenced Y chromosomes, we establish and date a detailed hg N phylogeny. We evaluate geographic structure by using 16 distinguishing binary markers in 1,631 hg N Y chromosomes from a collection of 6,521 samples from 56 populations. The more southerly distributed sub-clade N4 emerged before N2a1 and N3, found mostly in the north, but the latter two display more elaborate branching patterns, indicative of regional contrasts in recent expansions. In particular, a number of prominent and well-defined clades with common N3a3’6 ancestry occur in regionally dissimilar northern Eurasian populations, indicating almost simultaneous regional diversification and expansion within the last 5,000 years. This patrilineal genetic affinity is decoupled from the associated higher degree of language diversity. В общем, как понял, различные субклады N на севере Евразии расплодились буквально в последние где-то 5000 лет.
ВЛАДИМИР-III: А источник?
полная версия страницы