Форум » История » Генетика » Ответить
Генетика
ВЛАДИМИР-III: [quote]На параллельном форуме я договорился (в теме обсуждения прогноза на 2100) с ув. ВИРом, что добуду ему академическую статью с информацией о том, что СПИД неизлечим принципиально. И вот оттуда: цитата: По договоренности с ув. ВИРом, Ваш покорный слуга, как только покинули нас московские гости (еще хорошо, что не заехали на 3-ю улицу Строителей!), совершил научно-исследовательскую экспедицию в Библиотеку Академии Наук с целью отыскания академических статей на тему генетики СПИДа (кроме шуток - сейчас накоплено столько научных знаний, причем, очень специфических, что понятие археологические раскопки должно относиться не только к археологии). цитата: И меня ждало огромное разочарование. Я просмотрел не менее шести научных (я это подчеркиваю!) журналов из раздела генетики и цитологии, но за последние 8 (!) лет (и каких лет!) там не обнаружил ни одной статьи о ВИЧ, СПИДе и тому подобных материях. Равно отсутствуют научные статьи, которые доказывали бы излечимость СПИДа, и статьи, доказывающие его неизлечимость. Академическая наука просто самоустранилась от этой темы (и это показательно!) Так что все, что имеет человечество - это полу-популярные статьи и обзоры, на которые я ранее давал ссылки. И все. Как Вы полагаете, почему? Если же Вас интересует мнение почти специалиста, то моя современная девочка и без 5 минут жена, которая студентка нашего самого престижного питерского медвуза и как раз специализируется на этой теме (а Вы думали, откуда у меня интерес?), (она зарегистрирована на альтфоруме - не здесь - под ником Иштар) заметила, что обнадеживающий тон популярных статей, сообщающих о скорейшей разработике вакцины, необходим больным, чтобы у них была надежда на выздоровление. Цинично, но ничего другого не поделаешь. цитата: Тысяча чертей!!! Как же я забыл!??? Ведь двоюродный брат моего родителя - Сергей Алексеевич Булат - старший сотрудник ПИЯФ РАН. Вот его одна интересная статья (правда, на немного другую тему): http://hepd.pnpi.spb.ru/ioc/ioc/line021112/n2.html Так. В самое ближайшее время все академические данные будут. Зуб даю цитата: Ну ладно. Пока суд да дело, хочу поделиться другим "археологическим открытием". Я уже говорил, что шел искать преимущественно журнал "Цитология и генетика". Нашел я его быстро. Выходит он в Киеве (с 1967 года, поэтому все подозрения насчет несерьезности отпадают; это не брат всяческих "народных академий" последних 15 лет, наоборот, он возник в период реабилитации генетики). Как-то недавно, ув Мах заявил мне, что евреи (к примеру) являют собой единую и непрерывную генетическую цепь от Авраама до наших дней, отдельную от всех остальных. К несчастью (действительно, к несчастью) он вместо того, чтобы назвать еврейскую гаплогруппу цитата: Гаплогруппа (в популяционной генетике человека, науке, изучающей генетическую историю человечества) — большая группа схожих гаплотипов, которые являются рядом аллелей в определённых местах Y-хромосомы. Галпогруппы делятся на Y-хромосомные (Y-ДНК) и митохондриальные (мтДНК). Y-ДНК является прямой отцовской линией, а мтДНК прямой материнской линией, то есть дочь, мать, бабушка, прабабушка и так далее. цитата: которая характерна именно для всех евреев и более нигде не встречается (и мы бы потом элементарно проверили - так ли это), сослался на какую-то "скрытую" генетику (в генетике нет понятий "скрытая" и "явная" генетика - нет, и все!) И тут я набрел на две интересные статьи в журнале "Цитология и генетика" ISSN 0564-3783: Назарова А.Ф., Асланишвили В.О., Алхутов С.М. "Генетика и антропология народовм Кавказа и проблема происхождения "кавказоидов". № 5/2004 и Назаровой А.Ф. "К проблеме дифференциации северных монголоидов. европеоидов и америндов на территории Евразии (генетические данные) № 6/2002. Там великолепные таблицы таксономического расхождения в хронологическом порядке различных современных наций и народностейт (жаль не распечатал - спешил, да и не то совсем искал, а статьи о СПИДе - в следующий раз скопирую). Так вот. Те, кто думают, что евреи генетически ближе всего к арабам и прочим семитским народам, жестоко ошибаются. Наиболее близки евреям народы Кавказа - осетины, азербайджанцы, талыши, грузины, чеченцы, армяне - это что касается именно ближневосточных евреев. Немного дальше от них испанцы. А арабы и персы гораздо дальше, чем тоже довольно отдаленные русские и греки. Что же касается евреев в целом, то они генетически тюркский народ. Я сначала опешил и подумал: неужели Кестлер прав - вроде раскритиковали уже давно его теорию как несостоятельную. Но тут вспомнил: речь идет именно о дрейфе генов, а не о переселениях людей (иногда они не совпадают по масштабам). Дело было так: в Хазарском Каганате евреи не составляли этнического большинства, более того, скорее всего, даже среди иудаистов большинство были неевреи. После его распада какая-то часть тюрко-евреев и тюрков-иудаистов (видимо, очень небольшая, раз практически не попала в источники) переселились в Киевскую Русь, где встретились впоследствии с потоком еврейских переселенцев с Запада (после XIII-XIV вв), и их более сильные тюркские гены (которые сейчас лучше всего сохранились также в татарах) возобладали над "первично-еврейскими" (не буду употреблять неприличный термин, описывающий этот процесс, но вы поняли. что я имел в виду). А потом. поскольку доля еврейства Польши, Западной России, Словакии и Румынии в XIX веке была подавляющей в численности всего еврейства, эти гены рассеялись повсюду в мире, где жили евреи. Так что вполне можно употреблять термины: "слабые гены" и "сильные гены". И следовательно, никакой прямой и непрерывистой генетической последовательности нет. цитата: Еще интереснее генетическая история русских. Вот отгадайте, какой из народов мира ближе всего к русским? Могу спорить на... на что? что не догадаетесь. [/quote]
retrograde: Наткнулся на интересное. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25130626 Abstract OBJECTIVES: There is an ongoing effort to characterize the genetic links between Africa and Europe, mostly using lineages and haplotypes that are specific to one continent but had an ancient origin in the other. Mitochondrial DNA has been proven to be a very useful tool for this purpose since a high number of putatively European-specific variants of the African L* lineages have been defined over the years. Due to their geographic locations, Spain and Portugal seem to be ideal places for searching for these lineages. METHODS: Five members of a minor branch of haplogroup L3f were found in recent DNA samplings in the region of Asturias (Northern Spain), which is known for its historical isolation. The frequency of L3f in this population (≈1%) is unexpectedly high in comparison with other related lineages in Europe. Complete mitochondrial DNA sequencing of these L3f lineages, as well phylogenetic and phylogeographic comparative analyses have been performed. RESULTS: The L3f variant found in Asturias seems to constitute an Iberian-specific haplogroup, distantly related to lineages in Northern Africa and with a deep ancestry in Western Africa. Coalescent algorithms estimate the minimum arrival time as 8,000 years ago, and a possible route through the Gibraltar Strait. CONCLUSIONS: Results are concordant with a previously proposed Neolithic connection between Southern Europe and Western Africa, which might be key to the proper understanding of the ancient links between these two continents. Что это за возможный маленький заскок африканок в Астурию как минимум 8000 лет назад? Какие-нибудь протоберберы принесли?
ВЛАДИМИР-III: Ну видите - я ж говорил, что какие-то группы прибывали из Африки в Европу именно через Гибралтарский пролив. Я считал, что это ностратики (мадлен верхнего палеолита). Конкретно 8000 лет назад никого не могу назвать. Но это может быть "нижняя граница", а не дата. Протоберберы в Европу не проникали (ранее Средних Веков и Зиндана)))). Зато колоколовидных кубков подозревали в хаусаязычии. Однако, вроде в басском нет хаусаязычного субстрата.
retrograde: http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13997.html The African Genome Variation Project shapes medical genetics in Africa Что-то много букв там про евразийские примеси у африканцев. Интересно вот это. ancient Eurasian admixture was observed in central West African populations (Yoruba; ~7,500–10,500 years ago) Это что за люди евразийского происхождения могли в район йоруба попасть 7500-10500 лет назад? Конечно, не так далеко уж район чадских языков с их определенно евразийской гаплогруппой R1b, может, именно они и притащили в регион и другие евразийские гены?
retrograde: Хотя что-то могло быть принесено, например, фульбе? Или сонгайским народом зарма (часть его вроде не так далеко от йоруба)? Но это какие-то сравнительно недавние экспансии. Как и собственно хауса в сравнении с прачадскими временами...
ВЛАДИМИР-III: Йоруба считались чуть ли не егтиптянами. В хозяйственном отношении история Африки - это тоже некие волны, которые катились с северо-востока на юго-запад: доместикацимя дивотных, железо и т.д.
retrograde: А если всё дело в миграции иджо? Если они с верховий Нигера, то там и европеоидное что-то в генетике могли подхватить. А шли-то через территорию тех же йоруба...
ВЛАДИМИР-III: Нет, параевропеоиды фульбе пришли туда гораздо позже. Уже около начала н.э. А миграция иджо - 9 век до н.э. или около того.
retrograde: По Гренландии вышла интересная работа. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0116573 Peopling of the North Circumpolar Region – Insights from Y Chromosome STR and SNP Typing of Greenlanders The human population in Greenland is characterized by migration events of Paleo- and Neo-Eskimos, as well as admixture with Europeans. In this study, the Y-chromosomal variation in male Greenlanders was investigated in detail by typing 73 Y-chromosomal single nucleotide polymorphisms (Y-SNPs) and 17 Y-chromosomal short tandem repeats (Y-STRs). Approximately 40% of the analyzed Greenlandic Y chromosomes were of European origin (I-M170, R1a-M513 and R1b-M343). Y chromosomes of European origin were mainly found in individuals from the west and south coasts of Greenland, which is in agreement with the historic records of the geographic placements of European settlements in Greenland. Two Inuit Y-chromosomal lineages, Q-M3 (xM19, M194, L663, SA01 and L766) and Q-NWT01 (xM265) were found in 23% and 31% of the male Greenlanders, respectively. The time to the most recent common ancestor (TMRCA) of the Q-M3 lineage of the Greenlanders was estimated to be between 4,400 and 10,900 years ago (y. a.) using two different methods. This is in agreement with the theory that the North Circumpolar Region was populated via a second expansion of humans in the North American continent. The TMRCA of the Q-NWT01 (xM265) lineage in Greenland was estimated to be between 7,000 and 14,300 y. a. using two different methods, which is older than the previously reported TMRCA of this lineage in other Inuit populations. Our results indicate that Inuit individuals carrying the Q-NWT01 (xM265) lineage may have their origin in the northeastern parts of North America and could be descendants of the Dorset culture. This in turn points to the possibility that the current Inuit population in Greenland is comprised of individuals of both Thule and Dorset descent. 1) значительная европейская примесь 2) неоднородность собственно эскимосских Y-DNA гаплогрупп - возможно, в Гренландии было смешение культур туле и дорсет.
retrograde: Кстати, была работа по алеутам - там совсем весело. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19588274 Mitochondrial DNA and Y-chromosome variation in five eastern Aleut communities: evidence for genetic substructure in the Aleut population. The majority of Aleut Y-chromosomes were characterized to haplogroups of mostly Russian, Scandinavian and Western European origin (approximately 85%), which is in stark contrast to the 3.6% of Aleut mtDNA lineages identified as non-Native American, and thus indicating a large degree of asymmetrical gene flow between European men and Aleut women.
ВЛАДИМИР-III: retrograde пишет: значительная европейская примесь Если это не влияние викингов, то подтверждает происхождение эксимосов с Европейского Севера (аренсбургская и т.п. палеолитические культуры). По мере таянья Ледника эскимосы двигались за ним на северо-восток, пока не оказались на Аляске и т.д. retrograde пишет: Кстати, была работа по алеутам - там совсем весело. То же самое.
retrograde: http://biorxiv.org/content/early/2015/02/10/013433 Massive migration from the steppe is a source for Indo-European languages in Europe We generated genome-wide data from 69 Europeans who lived between 8,000-3,000 years ago by enriching ancient DNA libraries for a target set of almost four hundred thousand polymorphisms. Enrichment of these positions decreases the sequencing required for genome-wide ancient DNA analysis by a median of around 250-fold, allowing us to study an order of magnitude more individuals than previous studies and to obtain new insights about the past. We show that the populations of western and far eastern Europe followed opposite trajectories between 8,000-5,000 years ago. At the beginning of the Neolithic period in Europe, ~8,000-7,000 years ago, closely related groups of early farmers appeared in Germany, Hungary, and Spain, different from indigenous hunter-gatherers, whereas Russia was inhabited by a distinctive population of hunter-gatherers with high affinity to a ~24,000 year old Siberian6. By ~6,000-5,000 years ago, a resurgence of hunter-gatherer ancestry had occurred throughout much of Europe, but in Russia, the Yamnaya steppe herders of this time were descended not only from the preceding eastern European hunter-gatherers, but from a population of Near Eastern ancestry. Western and Eastern Europe came into contact ~4,500 years ago, as the Late Neolithic Corded Ware people from Germany traced ~3/4 of their ancestry to the Yamnaya, documenting a massive migration into the heartland of Europe from its eastern periphery. This steppe ancestry persisted in all sampled central Europeans until at least ~3,000 years ago, and is ubiquitous in present-day Europeans. These results provide support for the theory of a steppe origin of at least some of the Indo-European languages of Europe. Короче, у ямников субклады R1b внезапно нашлись: R1a and R1b are the most common haplogroups in many European populations today, and our results suggest that they spread into Europe from the East after 3,000 BCE. Two hunter-gatherers from Russia included in our study belonged to R1a (Karelia) and R1b (Samara), the earliest documented ancient samples of either haplogroup discovered to date. These two hunter-gatherers did not belong to the derived lineages M417 within R1a and M269 within R1b that are predominant in Europeans today, but all 7 Yamnaya males did belong to the M269 subclade of haplogroup R1b.
thrary: ВЛАДИМИР-III пишет: Если это не влияние викингов, то подтверждает происхождение эксимосов с Европейского Севера (аренсбургская и т.п. палеолитические культуры). По мере таянья Ледника эскимосы двигались за ним на северо-восток, пока не оказались на Аляске и т.д. Можливий варіянт більш пізніх европейських домішок.
retrograde: Genetic evidence for an origin of the Armenians from Bronze Age mixing of multiple populations Marc Haber , Massimo Mezzavilla , Yali Xue , David Comas , Paolo Gasparini , Pierre Zalloua , Chris Tyler-Smith http://biorxiv.org/content/early/2015/02/18/015396 The Armenians are a culturally isolated population who historically inhabited a region in the Near East bounded by the Mediterranean and Black seas and the Caucasus, but remain underrepresented in genetic studies and have a complex history including a major geographic displacement during World War One. Here, we analyse genome-wide variation in 173 Armenians and compare them to 78 other worldwide populations. We find that Armenians form a distinctive cluster linking the Near East, Europe, and the Caucasus. We show that Armenian diversity can be explained by several mixtures of Eurasian populations that occurred between ~3,000 and ~2,000 BCE, a period characterized by major population migrations after the domestication of the horse, appearance of chariots, and the rise of advanced civilizations in the Near East. However, genetic signals of population mixture cease after ~1,200 BCE when Bronze Age civilizations in the Eastern Mediterranean world suddenly and violently collapsed. Armenians have since remained isolated and genetic structure within the population developed ~500 years ago when Armenia was divided between the Ottomans and the Safavid Empire in Iran. Finally, we show that Armenians have higher genetic affinity to Neolithic Europeans than other present-day Near Easterners, and that 29% of the Armenian ancestry may originate from an ancestral population best represented by Neolithic Europeans. Итак, армяне генетически частично потомки неолитических европейцев. При чём в сравнении с другими ближневосточными популяциями это у них генетически очень заметно. То есть, наверное, носители праармянского языка, видимо, и в самом деле пришли из Европы?
ВЛАДИМИР-III: Армяне (во всяком случае в лингвистическом смысле) попали в Армению с Балкан (примерно из района совр. Македонии или около того). И кстати, там они становятся различимы где-то за 2000 лет до н.э. (именно тогда, когда якобы жил их прародитель-Гайк - поколенческая генеалогия?)
thrary: retrograde пишет: А это определённо какие-то миграции с Ближнего Востока - неолитические и\или бронзового века и позднее тоже? Пеласгі? 2 География расселения пеласгов 2.1 Крит 2.2 Пелопоннес 2.3 Беотия и Аттика 2.4 Фессалия, Эпир и Македония 2.5 Побережье Фракии и острова в северной части Эгейского моря 2.6 Острова и Малая Азия 2.7 Италия
ВЛАДИМИР-III: В Италию они попали, скорее. уже в конце своей истории. Истрия еще.
ВЛАДИМИР-III: ВЛАДИМИР-III пишет: Армяне (во всяком случае в лингвистическом смысле) попали в Армению с Балкан (примерно из района совр. Македонии или около того). И кстати, там они становятся различимы где-то за 2000 лет до н.э. (именно тогда, когда якобы жил их прародитель-Гайк - поколенческая генеалогия?) Пеонки, вроде, были их остатком в регионе Македонии.
retrograde: The complex admixture history and recent southern origins of Siberian populations http://biorxiv.org/content/early/2015/04/30/018770 Although Siberia was inhabited by modern humans at an early stage, there is still debate over whether this area remained habitable during the extremely cold period of the Last Glacial Maximum or whether it was subsequently repopulated by peoples with a recent shared ancestry. Previous studies of the genetic history of Siberian populations were hampered by the extensive admixture that appears to have taken place among these populations, since commonly used methods assume a tree-like population history and at most single admixture events. We therefore developed a new method based on the covariance of ancestry components, which we validated with simulated data, in order to investigate this potentially complex admixture history and to distinguish the effects of shared ancestry from prehistoric migrations and contact. We furthermore adapted a previously devised method of admixture dating for use with multiple events of gene flow, and applied these methods to whole-genome genotype data from over 500 individuals belonging to 20 different Siberian ethnolinguistic groups. The results of these analyses indicate that there have indeed been multiple layers of admixture detectable in most of the Siberian populations, with considerable differences in the admixture histories of individual populations, and with the earliest events dated to not more than 4500 years ago. Furthermore, most of the populations of Siberia included here, even those settled far to the north, can be shown to have a southern origin. These results provide support for a recent population replacement in this region, with the northward expansions of different populations possibly being driven partly by the advent of pastoralism, especially reindeer domestication. These newly developed methods to analyse multiple admixture events should aid in the investigation of similarly complex population histories elsewhere. Ну, вот, генетически коренным народам Сибири где-то не более, чем порядка 4500 лет. И всё пришли с юга.
ВЛАДИМИР-III: Правильно, якуты - с Байкала, до них - эти, эвенки - тоже с Байкала. Даже еще позже. Омоки? Омокская проблема. Их считают юкагирами и более-менее аборигенами (ну уж на расстоянии III тысячелетия до н.э. точно). С другой стороны вплоть до начала н.э. в Сибири должны были сохраняться какие-то реликты америндов. И не только те, что я нашел на Таймыре.
ВЛАДИМИР-III: Более того: "Сумнагинцы, которых предположительно относят к уральской языковой семье, генетически близки к палеолитическим приенисейским популяциям охотников на северного оленя, которые проникли в бассейн Лены на рубеже плейстоцена и голоцена (Мочанов, Федосеева, 1976, с 518). С ними же связываются древнейшие этапы формирования эскимосов и алеутов (Федосеева, 1999, с 83). По данным популяционной генетики свое происхождение от сумнагинцев ведут и чукчи (Мочанов, Федосеева, 1976, с 518)" Народы Северо-Востока Сибири. М.,2010, с 48. Правда, сумнагинцев еще считали денеязычными.
полная версия страницы